磁珠参数: 此试剂盒所用磁珠为无锡百迈格生物科技有限公司为NGS核酸片段筛选专门开发的磁珠(货号:BMS1000-2) 试剂盒储存条件及稳定性 试剂盒内组分室温保存即可,在适合的储存条件下该试剂盒未开封使用有效期为2年。 产品简介 该试剂盒采用磁珠纯化方式,适用于高通量测序文库(NGS)构建中DNA片段大小快速分选和回收。DNA片段筛选试剂盒的结合缓冲液中含有**顺磁珠,根据磁珠悬浮液和样品的体积比可选择性结合DNA片段。经过磁性分离和乙醇清洗,低盐洗脱缓冲液或无核酸酶水洗脱的高纯度的DNA片段不含有核苷酸,引物,接头,酶和盐等污染物,可被直接用于下游应用,比如:酶切、测序、杂交、PCR反应等后续操作。可应用于手动或自动液体操作设备。 产品优势 1. 适合DNA的片段范围广:100 bp~50 kb; 2. 回收率高:回收率高达80%以上; 3. DNA纯度高:回收的PCR产物纯度高; 4. 操作快速简单:20 min即可完成整个操作流程,*离心; 5. 可适用于自动化、高通量PCR产物纯化。 6. 该试剂盒使用步骤和国外beckman Ampure XP高度一致,直接替换 7. 价格低,订货期短等明显优势。 产品原理 图1(核酸纯化试剂盒大致工作原理) 自备仪器和试剂 1.磁力架(建议使用百迈格生物磁力架,货号:BMB16-0.2)。 2.洗涤液:80%乙醇水溶液。 3.洗脱液:Buffer EB(10mM Tris-HCl,pH 8.0);或者RNase-Free Water。 操作步骤 请参考Beckman Ampure XP产品,直接替换。 性能实例: 1.核酸片段筛选测试: 测试目的:通过DNA片段筛选测试*试剂盒与国外进口试剂盒性能差异 1)测试平台:安捷伦2100生物分析仪 2)实验方法:将大片段DNA打断后添加磁珠纯化试剂盒进行片段筛选,运用两步法对样品进行核酸片段筛选回收 图2如下: 图2,安捷伦2100生物分析仪片段选择对比测试结果:*试剂盒与国际商品化品牌Ampure XP 试剂盒核酸片段回收对比(左图为Ampure XP品牌核酸纯化试剂盒安捷伦2100生物分析仪检测回收核酸平均片段大小,平均片段大小为265;右图为*核酸纯化试剂盒利用安捷伦2100生物分析仪检测回收核酸平均片段大小,平均片段大小为265;)对比结果十分接近。 2. DNA回收效率测试 测试目的:检测对DNA片段的回收效率 实验方案:大片段DNA打断后,经试剂盒一步法纯化后(1.8X)测试DNA回收效率 表3如下: 测试品牌 DNA总投入量 纯化后DNA回收效率(%) Ampure XP-1 5ug 84.20% Ampure XP-2 5ug 83.87% *试剂盒-1 5ug 84.40% *试剂盒-2 5ug 84.12% 由表3可以看出,DNA回收效率测试结果相近,都达到80%以上。 3.主流测序仪测序测试 测试目的:通过市面上主流基因测序仪平台检验试剂盒稳定性 1)测试平台:Proton测序平台 2)实验步骤:生物样本提取出核酸后进行文库制备+上机测序 3)核酸样品总数12个:6个对照品,6个测试品,其中文库制备部分,分别采用本公司*的纯化试剂盒和Ampure XP商品化试剂盒进行核酸纯化。 表4如下: Proton 平台测试结果 对照组(Ampure XP) 测试组(*) 对比值 一比对率 5.17 5.42 0.25 GC含量平均值 41.14 40.85 - 0.29 原始数据积累平均值 6.88 7.33 0.45 根据表4体现的Proton测序分析结果看,表4中的一比对率与原始数据积累平均值越高越好,GC含量平均值对照组与测试组均符合标准。经测试结果分析,*核酸纯化试剂盒对比进口商品化试剂盒性能相差无异,能够有效的替代进口的磁珠纯化试剂盒。